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新疆农村信用社主要经营人民币存款、贷款以及各种资金结算、代收代付等中间业务，为全疆各族人民提供优质、高效、便捷的各类金融服务。截止2008年末，新疆农村信用社在全疆14个地州（市）设有合作银行、县（市）联社83家,营业网点1012个，职工总数9841人。各项存款552.5亿元，各项贷款301.6亿元，目前已形成了遍及城乡的服务网络。2008年,在中国银监会对农村中小金融机构经营及风险16项指标的排名中,新疆农村信用社14项指标跻身前十名,其中:农业贷款增幅、农户小额贷款覆盖率名列第一位。
